Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A1P52655 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms