Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAP1GDS1P52306 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms