Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSNK1EP49674 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSNK1EP49674 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms