Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACVR1BP36896 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ACVR1BP36896 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms