Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO1P25800 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO1P25800 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO1P25800 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO1P25800 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO1P25800 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO1P25800 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO1P25800 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO1P25800 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO1P25800 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO1P25800 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO1P25800 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO1P25800 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO1P25800 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO1P25800 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO1P25800 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO1P25800 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO1P25800 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO1P25800 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO1P25800 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO1P25800 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO1P25800 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO1P25800 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO1P25800 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO1P25800 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO1P25800 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO1P25800 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO1P25800 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO1P25800 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO1P25800 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO1P25800 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO1P25800 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO1P25800 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMO1P25800 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMO1P25800 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMO1P25800 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMO1P25800 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMO1P25800 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMO1P25800 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMO1P25800 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMO1P25800 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMO1P25800 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMO1P25800 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMO1P25800 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMO1P25800 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LMO1P25800 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMO1P25800 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMO1P25800 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMO1P25800 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMO1P25800 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMO1P25800 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMO1P25800 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMO1P25800 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMO1P25800 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMO1P25800 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMO1P25800 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMO1P25800 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LMO1P25800 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LMO1P25800 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LMO1P25800 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LMO1P25800 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LMO1P25800 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LMO1P25800 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LMO1P25800 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LMO1P25800 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LMO1P25800 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
LMO1P25800 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LMO1P25800 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO1P25800 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO1P25800 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO1P25800 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO1P25800 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO1P25800 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO1P25800 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO1P25800 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO1P25800 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO1P25800 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO1P25800 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO1P25800 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO1P25800 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO1P25800 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO1P25800 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
LMO1P25800 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LMO1P25800 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LMO1P25800 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO1P25800 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO1P25800 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMO1P25800 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO1P25800 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO1P25800 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO1P25800 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO1P25800 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO1P25800 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO1P25800 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO1P25800 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO1P25800 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO1P25800 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO1P25800 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO1P25800 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO1P25800 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms