Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms