Protein–RNA interactions for Protein: P05783

KRT18, Keratin, type I cytoskeletal 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT18P05783 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT18P05783 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT18P05783 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT18P05783 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT18P05783 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT18P05783 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT18P05783 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT18P05783 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT18P05783 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT18P05783 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT18P05783 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT18P05783 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT18P05783 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT18P05783 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT18P05783 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT18P05783 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT18P05783 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT18P05783 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT18P05783 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT18P05783 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT18P05783 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT18P05783 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT18P05783 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT18P05783 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT18P05783 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT18P05783 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT18P05783 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT18P05783 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT18P05783 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT18P05783 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT18P05783 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT18P05783 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT18P05783 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT18P05783 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT18P05783 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT18P05783 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT18P05783 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT18P05783 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT18P05783 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT18P05783 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT18P05783 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT18P05783 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT18P05783 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT18P05783 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT18P05783 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT18P05783 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT18P05783 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT18P05783 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT18P05783 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT18P05783 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT18P05783 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT18P05783 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT18P05783 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT18P05783 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT18P05783 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT18P05783 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT18P05783 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT18P05783 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT18P05783 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT18P05783 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT18P05783 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT18P05783 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT18P05783 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT18P05783 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT18P05783 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT18P05783 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT18P05783 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT18P05783 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT18P05783 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT18P05783 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT18P05783 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT18P05783 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT18P05783 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT18P05783 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT18P05783 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT18P05783 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT18P05783 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT18P05783 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT18P05783 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT18P05783 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT18P05783 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT18P05783 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT18P05783 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT18P05783 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT18P05783 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT18P05783 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT18P05783 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT18P05783 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT18P05783 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT18P05783 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT18P05783 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT18P05783 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT18P05783 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT18P05783 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT18P05783 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT18P05783 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT18P05783 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT18P05783 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT18P05783 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT18P05783 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms