Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MBD3O95983 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MBD3O95983 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MBD3O95983 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MBD3O95983 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MBD3O95983 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MBD3O95983 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MBD3O95983 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MBD3O95983 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MBD3O95983 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MBD3O95983 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MBD3O95983 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MBD3O95983 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MBD3O95983 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MBD3O95983 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MBD3O95983 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MBD3O95983 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MBD3O95983 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MBD3O95983 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MBD3O95983 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MBD3O95983 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MBD3O95983 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MBD3O95983 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MBD3O95983 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MBD3O95983 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MBD3O95983 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MBD3O95983 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MBD3O95983 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MBD3O95983 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MBD3O95983 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MBD3O95983 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MBD3O95983 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MBD3O95983 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MBD3O95983 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MBD3O95983 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MBD3O95983 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MBD3O95983 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MBD3O95983 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
MBD3O95983 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MBD3O95983 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MBD3O95983 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD3O95983 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD3O95983 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD3O95983 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD3O95983 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD3O95983 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD3O95983 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD3O95983 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD3O95983 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD3O95983 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD3O95983 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD3O95983 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD3O95983 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD3O95983 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD3O95983 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD3O95983 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD3O95983 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD3O95983 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD3O95983 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD3O95983 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD3O95983 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD3O95983 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD3O95983 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD3O95983 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD3O95983 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD3O95983 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD3O95983 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD3O95983 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD3O95983 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD3O95983 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD3O95983 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD3O95983 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD3O95983 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD3O95983 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD3O95983 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD3O95983 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MBD3O95983 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MBD3O95983 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MBD3O95983 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MBD3O95983 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MBD3O95983 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD3O95983 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD3O95983 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD3O95983 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD3O95983 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD3O95983 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD3O95983 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD3O95983 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD3O95983 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD3O95983 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD3O95983 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD3O95983 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD3O95983 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD3O95983 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD3O95983 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD3O95983 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD3O95983 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD3O95983 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD3O95983 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD3O95983 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms