Protein–RNA interactions for Protein: O95274

LYPD3, Ly6/PLAUR domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD3O95274 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LYPD3O95274 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LYPD3O95274 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LYPD3O95274 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LYPD3O95274 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LYPD3O95274 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LYPD3O95274 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LYPD3O95274 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LYPD3O95274 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LYPD3O95274 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LYPD3O95274 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYPD3O95274 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYPD3O95274 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYPD3O95274 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYPD3O95274 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYPD3O95274 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYPD3O95274 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYPD3O95274 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYPD3O95274 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYPD3O95274 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYPD3O95274 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYPD3O95274 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYPD3O95274 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYPD3O95274 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYPD3O95274 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYPD3O95274 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LYPD3O95274 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYPD3O95274 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYPD3O95274 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms