Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G8

TRBV10-2, T-cell receptor beta variable 10-2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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