Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms