Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms