Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AL354707.1-201ENST00000615168 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 DENND4C-205ENST00000434457 6718 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 DNM3-208ENST00000627582 7625 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 ZFAND6-220ENST00000561060 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC97Q96F63 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC97Q96F63 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC97Q96F63 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC97Q96F63 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC97Q96F63 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC97Q96F63 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC97Q96F63 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC97Q96F63 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC97Q96F63 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC97Q96F63 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC97Q96F63 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC97Q96F63 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC97Q96F63 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC97Q96F63 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC97Q96F63 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC97Q96F63 AL356488.3-201ENST00000608574 2888 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC97Q96F63 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC97Q96F63 DNAJB5-204ENST00000454002 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC97Q96F63 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC97Q96F63 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC97Q96F63 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms