Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms