Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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