Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACO1P21399 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACO1P21399 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACO1P21399 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACO1P21399 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACO1P21399 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACO1P21399 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACO1P21399 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACO1P21399 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACO1P21399 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACO1P21399 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACO1P21399 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACO1P21399 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACO1P21399 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACO1P21399 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACO1P21399 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACO1P21399 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACO1P21399 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACO1P21399 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACO1P21399 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACO1P21399 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACO1P21399 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACO1P21399 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACO1P21399 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACO1P21399 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACO1P21399 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACO1P21399 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACO1P21399 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACO1P21399 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACO1P21399 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACO1P21399 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACO1P21399 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACO1P21399 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACO1P21399 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACO1P21399 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACO1P21399 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACO1P21399 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACO1P21399 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACO1P21399 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACO1P21399 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACO1P21399 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACO1P21399 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACO1P21399 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACO1P21399 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACO1P21399 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACO1P21399 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACO1P21399 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACO1P21399 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms