Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 PTPRS-202ENST00000353284 4518 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 GRM4-204ENST00000535756 6670 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 CNKSR2-207ENST00000543067 4355 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 RPL13-201ENST00000311528 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 C4orf33-201ENST00000281146 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 AMBRA1-212ENST00000534300 5067 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms