Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CCDC78A2IDD5 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CCDC78A2IDD5 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CCDC78A2IDD5 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CCDC78A2IDD5 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CCDC78A2IDD5 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CCDC78A2IDD5 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CCDC78A2IDD5 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CCDC78A2IDD5 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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