Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms