Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms