Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms