Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms