Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms