Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms