Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms