Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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