Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms