Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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