Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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SPOCK3Q9BQ16 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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SPOCK3Q9BQ16 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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SPOCK3Q9BQ16 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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