Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CCDC96Q2M329 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CCDC96Q2M329 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CCDC96Q2M329 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CCDC96Q2M329 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CCDC96Q2M329 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CCDC96Q2M329 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CCDC96Q2M329 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CCDC96Q2M329 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CCDC96Q2M329 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CCDC96Q2M329 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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