Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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