Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IRX1P78414 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IRX1P78414 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
IRX1P78414 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
IRX1P78414 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
IRX1P78414 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
IRX1P78414 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
IRX1P78414 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
IRX1P78414 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
IRX1P78414 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
IRX1P78414 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
IRX1P78414 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
IRX1P78414 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
IRX1P78414 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IRX1P78414 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms