Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms