Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms