Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms