Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJB4Q9UDY4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms