Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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