Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 DRC7-203ENST00000394337 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 TGFBI-201ENST00000442011 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 MICAL2-201ENST00000256194 3906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 FLJ30679-201ENST00000624773 1980 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 TUFT1-202ENST00000368848 3033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AC135050.1-201ENST00000622229 3380 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 TXNRD1-201ENST00000354940 4082 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 NAB1-203ENST00000409641 2472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AC009533.1-201ENST00000539757 3158 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 GRIA4-202ENST00000393125 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 PML-207ENST00000435786 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX1P83916 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AIPL1-201ENST00000250087 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 PRKCQ-203ENST00000539722 3224 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AIF1L-201ENST00000247291 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 TSPEAR-201ENST00000323084 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 ABCB9-211ENST00000540285 3330 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 CACNA2D2-206ENST00000479441 3453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 PHF21B-203ENST00000403565 3586 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 TPO-204ENST00000382198 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 BOLL-201ENST00000282278 2742 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX1P83916 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 PLK4-209ENST00000513090 3123 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms