Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms