Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms