Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms