Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms