Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms