Protein–RNA interactions for Protein: P11362

FGFR1, Fibroblast growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR1P11362 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR1P11362 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms