Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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