Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms