Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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TCAF1Q9Y4C2 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TCAF1Q9Y4C2 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TCAF1Q9Y4C2 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TCAF1Q9Y4C2 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TCAF1Q9Y4C2 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TCAF1Q9Y4C2 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TCAF1Q9Y4C2 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TCAF1Q9Y4C2 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TCAF1Q9Y4C2 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TCAF1Q9Y4C2 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TCAF1Q9Y4C2 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TCAF1Q9Y4C2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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