Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms