Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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