Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms